显微计算机断层成像（Micro Computed Tomography，MicroCT），又称微型CT、显微CT，微焦点CT或者微型CT，是一种非破坏性的3D成像技术，可以在不破坏样本的情况下对各种离体样品、活体小动物等进行高分辨率二维和三维分析及内部显微结构观察，具有分辨率高（100~0.5μm）、成像范围小（直径12cm以内）、拓展性强（二维和三维分析及内部显微结构观察、力学结果输出）、应用范围广等特点，可用于医学、生物、考古、材料、电子、食品、地质学等诸多领域的研究。

其中，活体MicroCT配备如生命体征监测设备、呼吸门控系统和环境加热设备等多种设备和系统，不仅能够支持活体动物的扫描，也能实现牙齿、材料、岩石和金属等多种离体样本的扫描。

通过微焦点X射线管连续产生X射线束，经准直器和滤波器处理后，穿过固定在样品管中的样品；样品不同部位由于结构、密度等存在差异，对射线具有不同的吸收率，未被样品吸收的X射线经探测器收集得到不同的信号，输入计算机后经过图像处理算法的计算可还原出样品在某一角度的二维图像；

为了获得样品的三维图像，X射线管及探测器或样品会进行精确地定位和旋转，从而对样品进行360°投影（projection）与信号采集，最后通过一定的图像重建算法对样品进行三维结构再现。